IGTP
2026_130_POSICIÓ DE DOCTORAT EN GENÒMICA ESTADÍSTICA I MEDICINA DE PRECISIÓ EN DIABETIS DE TIPUS 2 (FINANÇADA PER FPI)
- Ubicación
- Badalona
- Jornada
- Temporal
- Publicada
- hace 4 días
Qué piden
ImprescindibleGenómicaMachine learningAnálisis estadísticoInglés
ValorableProgramación RProgramación PythonGWASBioinformática
Idiomasinglés alto
La oferta
DESCRIPCIÓN DE LA OCUPACIÓN
Oferim una posició de doctorat (PhD) finançada íntegrament en genòmica estadística i medicina de precisió , amb seu a l’Institut de Recerca Germans Trias i Pujol (IGTP, Badalona), sota la supervisió de la Dra. Sílvia Bonàs-Guarch (IP), amb la codirecció de la Dra. Anne L. Madsen, del Steno Diabetes Center Aarhus (Aarhus University Hospital, Dinamarca).
La posició està finançada a través de la convocatòria espanyola de «Proyectos de Generación de Conocimiento» (PEICTI 2024-2027) , mitjançant un contracte predoctoral FPI, i forma part d’un projecte de recerca de nova finançació sobre els mecanismes moleculars subjacents a la disfunció de les cèl·lules beta en la diabetis mellitus de tipus 2 (DM2), amb l’objectiu de millorar l’estratificació dels pacients i l’optimització dels tractaments mitjançant l’ús de dades de genòmica humana i de l’exposoma a gran escala.
Projecte
La persona doctoranda desenvoluparà puntuacions poligèniques específiques de mecanisme per a la disfunció de les cèl·lules beta dels illots pancreàtics, aprofitant la pleiotropia, la genòmica reguladora i enfocaments de machine learning generatiu, i les integrarà amb puntuacions basades en l’exposició per construir un model conjunt de susceptibilitat genètica i ambiental per a la subtipificació de la DM2. El projecte va més enllà dels models globals de risc genètic i se centra en models predictius interpretables i fonamentats biològicament de l’heterogeneïtat de la DM2, amb aplicacions directes en l’estratificació de pacients i la medicina de precisió. La persona doctoranda treballarà amb recursos a gran escala, incloent-hi l’UK Biobank, la cohort nacional GCAT pròpia i cohorts poblacionals daneses.
Entorn
La persona seleccionada s’incorporarà a la línia de recerca Medical Genomics and Precision Medicine for T2D , liderada per la Dra. Sílvia Bonàs-Guarch, dins del Genomes for Life-GCAT Lab, sota la supervisió del Dr. Rafa de Cid. Aquesta línia de recerca se centra en la comprensió dels determinants moleculars i ambientals que influeixen en el risc i la progressió de la diabetis mellitus de tipus 2. Dins del GCAT Lab, la persona doctoranda tindrà accés directe a infraestructures de genòmica poblacional, recursos computacionals i expertesa en genètica i exposoma. La codirecció i la col·laboració estreta amb la Dra. Anne L. Madsen (Steno Diabetes Center Aarhus) proporcionaran formació pràctica en la fenotipificació de les cèl·lules beta mitjançant la prova de tolerància oral a la glucosa (OGTT) i en epidemiologia clínica. El projecte també està integrat en una xarxa internacional de col·laboració que inclou el Dias & Frazer Lab (Centre for Genomic Regulation), el Prof. Torben Hansen (Novo Nordisk Foundation Centre for Basic Metabolic Research, CBMR, Dinamarca) i l’Assoc. Prof. Chirag Patel (Harvard Medical School), entre d’altres, i ofereix oportunitats de formació, estades de recerca i publicacions d’alt impacte.
Condicions de finançament
- Posició de doctorat de 4 anys finançada íntegrament (programa FPI, finançament estatal espanyol).
- Suport per a estades de recerca a l’estranger i assistència a congressos.
FUNCIONES
La persona seleccionada contribuirà a un projecte de recerca orientat al desenvolupament de models predictius per a la diabetis mellitus de tipus 2 basats en informació molecular, mitjançant la integració de dades de genòmica humana i d’exposoma a gran escala. Les principals funcions inclouran:
- Desenvolupar puntuacions poligèniques específiques de mecanisme per a la disfunció de les cèl·lules beta pancreàtiques mitjançant conjunts de dades GWAS, models genètics basats en la pleiotropia, genòmica funcional reguladora i enfocaments avançats de machine learning.
- Desenvolupar i avaluar puntuacions basades en l’exposició i integrar-les amb puntuacions poligèniques per construir models conjunts de susceptibilitat genètica i ambiental per a l’estratificació de pacients i la medicina de precisió.
- Analitzar i integrar conjunts de dades genòmiques, fenotípiques i d’exposoma a gran escala procedents de cohorts poblacionals, incloent-hi l’UK Biobank, la cohort GCAT i cohorts poblacionals daneses.
- Investigar l’heterogeneïtat molecular i genètica subjacent a la disfunció de les cèl·lules beta i a la diabetis mellitus de tipus 2 mitjançant enfocaments estadístics, computacionals i de genòmica integrativa avançats.
- Traslladar els descobriments genètics a models de predicció del risc clínicament interpretables, amb aplicacions en la predicció de la malaltia, l’estratificació de pacients i l’optimització dels tractaments.
- Preparar manuscrits científics i presentar els resultats en congressos nacionals i internacionals.
- Participar en activitats de recerca col·laborativa i en estades de recerca internacionals amb els socis del projecte, incloent-hi el Steno Diabetes Center Aarhus (Dinamarca).
SE REQUIERE
- Titulació de màster (o equivalent) en Bioinformàtica, Biologia Computacional, Estadística, Ciència de Dades, Genètica, Ciències Biomèdiques, Biotecnologia, Informàtica o una disciplina relacionada.
- Les persones candidates han de complir els requisits d’elegibilitat per a l’admissió a un programa oficial de doctorat en una universitat espanyola.
- Experiència amb R/Python.
- Interès en genètica humana, òmiques, malalties complexes i biologia basada en dades.
- Bones capacitats analítiques i de resolució de problemes, així com capacitat per treballar de manera autònoma dins d’un equip distribuït.
SE OFRECE
- Contracte predoctoral a temps complet de quatre anys (FPI), associat al projecte de recerca finançat en el marc del programa espanyol de «Proyectos de Generación de Conocimiento» (PEICTI 2024–2027).
- Jornada completa (100% de dedicació), d’acord amb la normativa aplicable als contractes predoctorals FPI.
- Data d’incorporació: gener de 2027, un cop finalitzat el procés de selecció.
- Retribució bruta d’acord amb les escales salarials establertes per als contractes predoctorals FPI en el marc del programa espanyol de «Proyectos de Generación de Conocimiento».
- La retribució bruta anual corresponent a la plaça objecte d’aquesta convocatòria es fixarà en funció de l’experiència acreditada i les competències de la persona candidata, distribuïda en 12 pagues.
- Retribució flexible (tiquets guarderia).
- 23 dies de vacances i 5 dies de lliure disposició.
- Càpsules formatives a càrrec de l’empresa.
- Formar part d’un excel·lent centre de recerca multidisciplinari amb el segell HRS4R.
- Ubicació al Campus Can Ruti, un entorn de recerca translacional de primer nivell a l’àrea de Barcelona, en un entorn científic molt estimulant. L’IGTP ofereix un ecosistema de suport, proper i col·laboratiu per afavorir el desenvolupament professional i ajudar-te a assolir els teus objectius de recerca.
PARA MÁS INFORMACIÓN
Per a més informació, podeu contactar amb la Dra. Sílvia Bonàs Guarch (IP) a sbonas@igtp.cat
o consultar https://www.germanstrias.org/ca/projectes-estrategics/gcat/1/gcat-genomes-for-life#tab-2
PRESENTACIÓN DE SOLICITUDES
Les persones interessades han d’adjuntar a la sol·licitud:
- Carta de motivació en què expliquin el seu interès per la posició.
- CV actualitzat.
- Dades de contacte de 2-3 persones de referència.
Les candidatures seran avaluades d’acord amb els principis i objectius que regeixen els sistemes de selecció, seguint el procés que es descriu a continuació:
- Avaluació curricular : anàlisi del currículum vitae per valorar els aspectes relacionats amb la formació, la trajectòria professional i l’experiència en llocs de treball relacionats amb la posició objecte de selecció.
- Entrevista personal : un cop avaluat el currículum, les persones candidates seleccionades seran convocades a una entrevista personal per verificar i ampliar la informació detallada al currículum i per avaluar aspectes relacionats amb l’experiència i les competències professionals.
No es tindran en compte en el procés de selecció les candidatures que no compleixin els requisits, que no estiguin incloses en els supòsits previstos o que no es tramitin d’acord amb el procediment establert.
PLAZO DE PRESENTACIÓN
El termini de presentació de candidatures finalitzarà el 31 d’octubre de 2026.